Należy pamiętać, że skutki uboczne chlorochiny, w tym toksyczność dla oczu, ograniczają jej długotrwałe stosowanie. Leczenie chlorochiną może prowadzić do nieodwracalnego uszkodzenia siatkówki i poważnej utraty ostrości wzroku oraz do zmian w polu widzenia. Zmiany siatkówki są nie tylko nieodwracalne, ale mogą nadal postępować po odstawieniu leku.